Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3glb1Q9JK48 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3glb1Q9JK48 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3glb1Q9JK48 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3glb1Q9JK48 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3glb1Q9JK48 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3glb1Q9JK48 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3glb1Q9JK48 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3glb1Q9JK48 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3glb1Q9JK48 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3glb1Q9JK48 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3glb1Q9JK48 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3glb1Q9JK48 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3glb1Q9JK48 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3glb1Q9JK48 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3glb1Q9JK48 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3glb1Q9JK48 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3glb1Q9JK48 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms