Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Copb1Q9JIF7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copb1Q9JIF7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Copb1Q9JIF7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Copb1Q9JIF7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Copb1Q9JIF7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copb1Q9JIF7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copb1Q9JIF7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copb1Q9JIF7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copb1Q9JIF7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms