Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RabggtaQ9JHK4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RabggtaQ9JHK4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RabggtaQ9JHK4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RabggtaQ9JHK4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RabggtaQ9JHK4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RabggtaQ9JHK4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RabggtaQ9JHK4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RabggtaQ9JHK4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RabggtaQ9JHK4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RabggtaQ9JHK4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RabggtaQ9JHK4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RabggtaQ9JHK4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RabggtaQ9JHK4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RabggtaQ9JHK4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RabggtaQ9JHK4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RabggtaQ9JHK4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RabggtaQ9JHK4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RabggtaQ9JHK4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RabggtaQ9JHK4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
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