Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tcirg1Q9JHF5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcirg1Q9JHF5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcirg1Q9JHF5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms