Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH3

Vps35, Vacuolar protein sorting-associated protein 35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps35Q9EQH3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps35Q9EQH3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps35Q9EQH3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps35Q9EQH3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms