Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms