Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clstn1Q9EPL2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clstn1Q9EPL2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clstn1Q9EPL2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms