Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pop7Q9DCH2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop7Q9DCH2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pop7Q9DCH2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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