Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Swt1Q9DBQ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Swt1Q9DBQ9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Swt1Q9DBQ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Swt1Q9DBQ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Swt1Q9DBQ9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Swt1Q9DBQ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Swt1Q9DBQ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Swt1Q9DBQ9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Swt1Q9DBQ9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Swt1Q9DBQ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Swt1Q9DBQ9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Swt1Q9DBQ9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Swt1Q9DBQ9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Swt1Q9DBQ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Swt1Q9DBQ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Swt1Q9DBQ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Swt1Q9DBQ9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Swt1Q9DBQ9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Swt1Q9DBQ9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms