Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ftsj3Q9DBE9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ftsj3Q9DBE9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ftsj3Q9DBE9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ftsj3Q9DBE9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ftsj3Q9DBE9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ftsj3Q9DBE9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ftsj3Q9DBE9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ftsj3Q9DBE9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ftsj3Q9DBE9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ftsj3Q9DBE9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ftsj3Q9DBE9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ftsj3Q9DBE9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ftsj3Q9DBE9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ftsj3Q9DBE9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ftsj3Q9DBE9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ftsj3Q9DBE9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms