Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg9Q9DB90 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg9Q9DB90 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg9Q9DB90 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg9Q9DB90 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg9Q9DB90 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg9Q9DB90 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg9Q9DB90 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg9Q9DB90 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg9Q9DB90 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg9Q9DB90 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg9Q9DB90 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg9Q9DB90 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg9Q9DB90 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg9Q9DB90 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg9Q9DB90 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg9Q9DB90 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg9Q9DB90 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg9Q9DB90 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg9Q9DB90 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms