Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scp2d1Q9DAH1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scp2d1Q9DAH1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scp2d1Q9DAH1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms