Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA79

Dpep3, Dipeptidase 3, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpep3Q9DA79 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dpep3Q9DA79 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dpep3Q9DA79 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dpep3Q9DA79 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dpep3Q9DA79 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dpep3Q9DA79 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dpep3Q9DA79 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dpep3Q9DA79 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dpep3Q9DA79 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpep3Q9DA79 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpep3Q9DA79 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpep3Q9DA79 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpep3Q9DA79 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpep3Q9DA79 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpep3Q9DA79 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpep3Q9DA79 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpep3Q9DA79 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms