Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn34b2Q9D9N2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn34b2Q9D9N2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
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