Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hm13Q9D8V0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hm13Q9D8V0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hm13Q9D8V0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms