Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D8N1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D8N1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D8N1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D8N1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D8N1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D8N1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D8N1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Q9D8N1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Q9D8N1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D8N1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D8N1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.8 ms