Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp5Q9D7S9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chmp5Q9D7S9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chmp5Q9D7S9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chmp5Q9D7S9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chmp5Q9D7S9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chmp5Q9D7S9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chmp5Q9D7S9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chmp5Q9D7S9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chmp5Q9D7S9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chmp5Q9D7S9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chmp5Q9D7S9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chmp5Q9D7S9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Chmp5Q9D7S9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms