Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rabl3Q9D4V7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rabl3Q9D4V7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rabl3Q9D4V7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabl3Q9D4V7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabl3Q9D4V7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rabl3Q9D4V7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rabl3Q9D4V7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rabl3Q9D4V7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rabl3Q9D4V7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rabl3Q9D4V7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rabl3Q9D4V7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabl3Q9D4V7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabl3Q9D4V7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rabl3Q9D4V7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rabl3Q9D4V7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rabl3Q9D4V7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rabl3Q9D4V7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rabl3Q9D4V7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms