Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rasgef1cQ9D300 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rasgef1cQ9D300 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rasgef1cQ9D300 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasgef1cQ9D300 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms