Protein–RNA interactions for Protein: Q9D291

Desi2, Desumoylating isopeptidase 2, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Desi2Q9D291 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Desi2Q9D291 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Desi2Q9D291 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Desi2Q9D291 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Desi2Q9D291 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Desi2Q9D291 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Desi2Q9D291 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Desi2Q9D291 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Desi2Q9D291 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Desi2Q9D291 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Desi2Q9D291 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Desi2Q9D291 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Desi2Q9D291 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Desi2Q9D291 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Desi2Q9D291 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Desi2Q9D291 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Desi2Q9D291 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Desi2Q9D291 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Desi2Q9D291 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Desi2Q9D291 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Desi2Q9D291 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Desi2Q9D291 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Desi2Q9D291 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Desi2Q9D291 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms