Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M0

Sec13, Protein SEC13 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec13Q9D1M0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec13Q9D1M0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec13Q9D1M0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms