Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Thumpd2Q9CZB3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Thumpd2Q9CZB3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Thumpd2Q9CZB3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms