Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ssu72Q9CY97 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssu72Q9CY97 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssu72Q9CY97 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssu72Q9CY97 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms