Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc17Q9CXD9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc17Q9CXD9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc17Q9CXD9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms