Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rbm8aQ9CWZ3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbm8aQ9CWZ3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbm8aQ9CWZ3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbm8aQ9CWZ3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbm8aQ9CWZ3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbm8aQ9CWZ3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbm8aQ9CWZ3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbm8aQ9CWZ3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbm8aQ9CWZ3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbm8aQ9CWZ3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbm8aQ9CWZ3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbm8aQ9CWZ3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rbm8aQ9CWZ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rbm8aQ9CWZ3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbm8aQ9CWZ3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbm8aQ9CWZ3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbm8aQ9CWZ3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms