Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp5sQ9CRA7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp5sQ9CRA7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp5sQ9CRA7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp5sQ9CRA7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp5sQ9CRA7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp5sQ9CRA7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp5sQ9CRA7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms