Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR25

Dph2, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 2, mousemouse

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph2Q9CR25 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dph2Q9CR25 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dph2Q9CR25 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dph2Q9CR25 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dph2Q9CR25 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dph2Q9CR25 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dph2Q9CR25 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dph2Q9CR25 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dph2Q9CR25 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dph2Q9CR25 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dph2Q9CR25 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dph2Q9CR25 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dph2Q9CR25 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dph2Q9CR25 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dph2Q9CR25 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms