Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PsenenQ9CQR7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PsenenQ9CQR7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PsenenQ9CQR7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PsenenQ9CQR7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms