Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pkp2Q9CQ73 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pkp2Q9CQ73 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pkp2Q9CQ73 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pkp2Q9CQ73 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkp2Q9CQ73 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkp2Q9CQ73 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkp2Q9CQ73 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms