Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpa3Q9CQ71 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpa3Q9CQ71 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms