Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4dQ99N05 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a4dQ99N05 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms