Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcf2Q99LE6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcf2Q99LE6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcf2Q99LE6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcf2Q99LE6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcf2Q99LE6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcf2Q99LE6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcf2Q99LE6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcf2Q99LE6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcf2Q99LE6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf2Q99LE6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcf2Q99LE6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms