Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PpifQ99KR7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpifQ99KR7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms