Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmd6Q99JI4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmd6Q99JI4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd6Q99JI4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmd6Q99JI4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms