Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk9Q99J95 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk9Q99J95 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms