Protein–RNA interactions for Protein: Q924W6

Trim66, Tripartite motif-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim66Q924W6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim66Q924W6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim66Q924W6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim66Q924W6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim66Q924W6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim66Q924W6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim66Q924W6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim66Q924W6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim66Q924W6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim66Q924W6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim66Q924W6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim66Q924W6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim66Q924W6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim66Q924W6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim66Q924W6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms