Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smc6Q924W5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smc6Q924W5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smc6Q924W5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms