Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpe65Q91ZQ5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpe65Q91ZQ5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms