Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tdrd3Q91W18 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tdrd3Q91W18 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Tdrd3Q91W18 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tdrd3Q91W18 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tdrd3Q91W18 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tdrd3Q91W18 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tdrd3Q91W18 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tdrd3Q91W18 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tdrd3Q91W18 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tdrd3Q91W18 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tdrd3Q91W18 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tdrd3Q91W18 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tdrd3Q91W18 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd3Q91W18 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tdrd3Q91W18 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd3Q91W18 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms