Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDQ1

Ptgr2, Prostaglandin reductase 2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgr2Q8VDQ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptgr2Q8VDQ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptgr2Q8VDQ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptgr2Q8VDQ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptgr2Q8VDQ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptgr2Q8VDQ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Ptgr2Q8VDQ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptgr2Q8VDQ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptgr2Q8VDQ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Ptgr2Q8VDQ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Ptgr2Q8VDQ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptgr2Q8VDQ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms