Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn4Q8VCH8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn4Q8VCH8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn4Q8VCH8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms