Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clptm1Q8VBZ3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clptm1Q8VBZ3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms