Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBY2

Camkk1, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camkk1Q8VBY2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Camkk1Q8VBY2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Camkk1Q8VBY2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Camkk1Q8VBY2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Camkk1Q8VBY2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Camkk1Q8VBY2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Camkk1Q8VBY2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Camkk1Q8VBY2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Camkk1Q8VBY2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Camkk1Q8VBY2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Camkk1Q8VBY2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Camkk1Q8VBY2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Camkk1Q8VBY2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Camkk1Q8VBY2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Camkk1Q8VBY2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Camkk1Q8VBY2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Camkk1Q8VBY2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Camkk1Q8VBY2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Camkk1Q8VBY2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Camkk1Q8VBY2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Camkk1Q8VBY2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Camkk1Q8VBY2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Camkk1Q8VBY2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Camkk1Q8VBY2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Camkk1Q8VBY2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Camkk1Q8VBY2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Camkk1Q8VBY2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Camkk1Q8VBY2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Camkk1Q8VBY2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Camkk1Q8VBY2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Camkk1Q8VBY2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Camkk1Q8VBY2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Camkk1Q8VBY2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Camkk1Q8VBY2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Camkk1Q8VBY2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Camkk1Q8VBY2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Camkk1Q8VBY2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Camkk1Q8VBY2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Camkk1Q8VBY2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Camkk1Q8VBY2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Camkk1Q8VBY2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Camkk1Q8VBY2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Camkk1Q8VBY2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Camkk1Q8VBY2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Camkk1Q8VBY2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Camkk1Q8VBY2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms