Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBX4

Cd207, C-type lectin domain family 4 member K, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd207Q8VBX4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd207Q8VBX4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd207Q8VBX4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd207Q8VBX4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd207Q8VBX4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd207Q8VBX4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd207Q8VBX4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd207Q8VBX4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd207Q8VBX4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd207Q8VBX4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd207Q8VBX4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd207Q8VBX4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd207Q8VBX4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd207Q8VBX4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd207Q8VBX4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd207Q8VBX4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd207Q8VBX4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd207Q8VBX4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd207Q8VBX4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd207Q8VBX4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd207Q8VBX4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd207Q8VBX4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd207Q8VBX4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd207Q8VBX4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd207Q8VBX4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms