Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup35Q8R4R6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup35Q8R4R6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms