Protein–RNA interactions for Protein: Q8R105

Vps37c, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37cQ8R105 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps37cQ8R105 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps37cQ8R105 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms