Protein–RNA interactions for Protein: Q8K572

Hus1b, Checkpoint protein HUS1B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hus1bQ8K572 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hus1bQ8K572 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hus1bQ8K572 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hus1bQ8K572 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hus1bQ8K572 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hus1bQ8K572 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hus1bQ8K572 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hus1bQ8K572 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hus1bQ8K572 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hus1bQ8K572 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hus1bQ8K572 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hus1bQ8K572 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hus1bQ8K572 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms