Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H7

Slc45a3, Solute carrier family 45 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a3Q8K0H7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc45a3Q8K0H7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc45a3Q8K0H7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc45a3Q8K0H7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc45a3Q8K0H7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc45a3Q8K0H7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc45a3Q8K0H7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc45a3Q8K0H7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc45a3Q8K0H7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc45a3Q8K0H7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms