Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ91

Cd209b, CD209 antigen-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd209bQ8CJ91 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd209bQ8CJ91 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd209bQ8CJ91 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd209bQ8CJ91 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd209bQ8CJ91 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd209bQ8CJ91 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd209bQ8CJ91 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd209bQ8CJ91 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd209bQ8CJ91 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd209bQ8CJ91 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cd209bQ8CJ91 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cd209bQ8CJ91 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd209bQ8CJ91 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd209bQ8CJ91 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cd209bQ8CJ91 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd209bQ8CJ91 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd209bQ8CJ91 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd209bQ8CJ91 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd209bQ8CJ91 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms