Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHB8

Ttll5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, mousemouse

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll5Q8CHB8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ttll5Q8CHB8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ttll5Q8CHB8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ttll5Q8CHB8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ttll5Q8CHB8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ttll5Q8CHB8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ttll5Q8CHB8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ttll5Q8CHB8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ttll5Q8CHB8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ttll5Q8CHB8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ttll5Q8CHB8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ttll5Q8CHB8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ttll5Q8CHB8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ttll5Q8CHB8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ttll5Q8CHB8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ttll5Q8CHB8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ttll5Q8CHB8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ttll5Q8CHB8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ttll5Q8CHB8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ttll5Q8CHB8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Ttll5Q8CHB8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ttll5Q8CHB8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ttll5Q8CHB8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ttll5Q8CHB8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ttll5Q8CHB8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ttll5Q8CHB8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ttll5Q8CHB8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ttll5Q8CHB8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ttll5Q8CHB8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ttll5Q8CHB8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ttll5Q8CHB8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ttll5Q8CHB8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ttll5Q8CHB8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ttll5Q8CHB8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ttll5Q8CHB8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ttll5Q8CHB8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ttll5Q8CHB8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ttll5Q8CHB8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ttll5Q8CHB8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ttll5Q8CHB8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ttll5Q8CHB8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.3 ms